吉木萨尔县位于新疆维吾尔自治区天山北麓东端，准噶尔盆地东南缘，东经deg;′－deg;′，北纬deg;′－deg;，东邻奇台县，西与阜康市接壤，北越卡拉麦里岭和富蕴县相连，南以博格达山分水岭同吐鲁番地区、乌鲁木齐市为界。县城吉木萨尔镇。全县总面积平方公里，下辖乡镇，个行政村。

县城西距自治区首府乌鲁木齐市公里，距昌吉回族自治州首府昌吉市公里。全县总面积平方公里，下辖乡镇，个行政村，境内有新疆生产建设兵团 农六师个团场，有汉族、回族、哈萨克族、维吾尔族、蒙古族等个民族，总人口.万人，其中少数民族人口占%。

年被国务院批准为对外开放县，荣获全国科技进步先进县、全国科普示范县、自治区历史文化名城、自治区园林县城、自治区婚育新风进万家活动先进县，北庭西大寺被评为国家级民族团结教育基地，有个单位获得自治区级以上表彰。年地区生产总值亿元，同比增长（下同）.%；固定资产投资亿元，增长%；完成地方财政一般预算收入.亿元，增长.%。

地势南北高、中间低，地貌可分为南部山区、中部平原、北部沙漠三种类型。主要河流有二工河、西大龙口河、渭户沟河、白杨河等。属温带大陆性气候，冬季长而严寒，夏季短而炎热，春秋季节不明显，干旱少雨，昼夜温差大。